为了修复被超大型巨人破坏的墙壁上的洞，艾伦他们出发进行外墙修复作战然而在路上，巨人的突袭让一行陷入窘境。率领着调查兵团的“人类最强的男人”敷岛的出现将他们从危机中拯救出来，但巨人进攻的脚步并未放缓。这时，负伤的艾伦为了救下同伴阿明，被巨人吞了下去……正当所有人开始陷入绝望的时候，神秘的黑发巨人突然出现，开始驱逐其它巨人。“这次作战若是失败，人类才真的要完了。”巨人为何会出现？人类为何而战斗……现在，人类即将开始最后的反击。